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三級剪切研磨均質機藻類的厚壁孢子具有堅韌的細胞壁，會阻礙對細胞內生物質的提取。因此在提取海藻油前，必須對海藻細胞進行破壁處理。超聲波法或超微加超聲法是目前實驗室對藻細胞進行破壁的常用方式，且破壁效率高，一般細胞破壁率都可以達到95-98%。在海藻生物柴油工廠采用這類破壁方法存在兩個主要問題，一是設備昂貴，二是能耗高。采用機械破壁法、物理法和酶解法對螺旋藻進行破壁試驗證實，機構法的破壁效果較好且易操
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